Прошло уже более полувека с момента основания винодельческого предприятия на территории античного города Фанагория, которое было названо в его честь. История компании Фанагория изобилует десятилетиями упорного труда и впечатляющими достижениями. Начало хозяйства было положено в 1957 году с создания Сенновского винпункта, который с 1963 года стал винно-соковым заводом, затем превратившись в крупнейшее в СССР и второе по величине в Европе предприятие по производству натуральных виноградных соков. Этот завод стал поставщиком сортовых виноградных соков для Олимпиады в Москве в 1980 году. Сырье для производства предоставлялось винсовхозом Фанагорийский, который специализировался на виноградарстве. В 1996 году оба предприятия объединились в компанию под названием Фанагория.
На сегодняшний день Фанагория является одним из крупнейших винодельческих предприятий России со весьма развитым циклом производства. Здесь выращивают саженцы, виноград, а также производят различные виды алкогольных напитков: тихие, игристые и десертные вина, бренди и чачу под торговой маркой Fanagoria с географическим указанием "Кубань. Таманский полуостров" и наименованием места происхождения "Сенной". Вина этого предприятия изготавливаются исключительно из собственного винограда, выращиваемого в историческом винодельческом регионе Фанагория на Таманском полуострове между Таманским заливом Черного моря и Азовским морем.
Фанагория владеет виноградниками площадью более 3,4 тыс. гектаров, а также виноградным питомником. Максимальный возраст виноградных лоз на виноградниках составляет 37 лет. В предприятии, единственном в России среди винодельческих предприятий, существует бондарный цех, где изготавливают бочки из кавказского дуба, достигающего возраста 80-120 лет, емкостью от 30 до 600 л для выдержки вин и коньяков. На виноградниках практикуется листоудаление и зеленый сбор, что позволяет поддерживать высокое качество урожая. Благодаря этому продукция Фанагории регулярно завоевывает медали на международных выставках в различных странах мира.