Шато Канон уникально расположен на вершине известнякового плато Сент-Эмильон и берет свое начало еще в 1700-х годах как часть виноградника Кло Сен-Мартен. Оно было приобретено Жаком Каноном в 1760 году, когда его размеры составляли всего 13 гектаров. Жак был неординарной личностью и заработал свое состояние, работая капером, что в то время было синонимом слова "пират". После увеличения площади виноградников и строительства замка в 1767 году, Жак продал поместье Раймонду Фонтемуану, торговцу вином из Бордо.
Существует две версии происхождения названия Шато Канон. По одной из них, оно является фонетическим отражением фамилии первоначального владельца – Канона. Однако семья Фонтемуан, купившая поместье в Сент-Эмильоне, владела во Фронсаке и там же недвижимостью с таким же названием, поэтому было решено объединить оба винодельческих предприятия под одним именем. В 1770 году вина Шато Канон стали признанными в регионе. Название стало официальным в 1853 году.
Семья Фонтемуа владела виноградниками до 1857 года, после чего поместье несколько раз сменило владельцев, пока не оказалось у Габриэля Супау, который передал его своей дочери и зятю, Андре Фурнье. Семья Фурнье вложила много усилий в модернизацию производства и реставрацию замка. Владение Шато Каноном продолжалось до 1996 года, когда оно было приобретено братьями Вертхаймер, владельцами дома моды Chanel. Проводились работы по пересадке виноградников, обновлению оборудования и реконструкции замка.
Сегодня под виноградниками Шато Канон находится уникальный комплекс тоннелей, образовавшийся во времена добычи известняка для строительства зданий региона. Это стало популярным объектом туризма.
Общая площадь виноградников Шато Канон составляет 34 гектара, из которых 24 гектара отнесены к Premier Cru, используемых для создания лучших вин Шато Канон.